萃取柱的種類很多，具體實驗工作中，需根據分析對象、檢測手段及實驗室條件合理選擇合適填料、合理規格的萃取柱。要考慮萃取柱對分析對象的萃取能力、樣品溶液的體積、洗脫后溶液的終體積及樣品溶液中被測物及干擾物的總量。

　　一般被柱中吸附劑吸附的被測物及干擾物的總質量不應超過吸附物總質量的5%。洗脫劑的體積一般應是萃取柱柱床體積的2-5倍。

　　偶氮萃取柱實驗時可能會出現凈化效果不理想的現象，對此可針對凈化模式進行改進：

　　通常而言采用保留目標化合物的模式比保留雜質的模式凈化效果好，如果正在分析的項目為某一種或某一類化合物分析，可采用保留目標化合物的凈化模式；舉個簡單的例子，同樣是分析蔬菜中的多菌靈和噻菌靈(一類堿性農藥)，使用陽離子交換柱可以專一性地保留這些農藥，使它們基本與干擾物*分離，而使用正相吸附劑或石墨化炭黑進行保留干擾物的操作僅能把主要的干擾物除去，仍有較多干擾物存留。

　　另外，如果不止一種萃取柱可用于目標化合物的凈化時，應挑選選擇性好的吸附劑；在選擇性方面：離子交換＞正相＞反相。